Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
PRKCHP24723 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PRKCHP24723 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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