Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PRKCA-AS1-203ENST00000584715 2113 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 KCNJ15-205ENST00000398930 2914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SEC14L1-205ENST00000443798 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 FBXO18-202ENST00000379999 3702 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 COL10A1-202ENST00000327673 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 GK3P-201ENST00000505354 1868 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SSPN-202ENST00000422622 4348 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ZNF418-202ENST00000425570 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LRP1-202ENST00000338962 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC090616.7-201ENST00000625123 2179 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL355482.1-201ENST00000411509 2463 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 MSL3-202ENST00000337339 3446 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 FAM124B-202ENST00000389874 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 POLN-201ENST00000382865 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 GJA5-203ENST00000621517 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 TFCP2L1-201ENST00000263707 9292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SIRPB2-201ENST00000359801 2642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 IGSF5-201ENST00000380588 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RSBN1L-203ENST00000445288 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SF3B2-206ENST00000528302 3254 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 B3GALNT1-208ENST00000473285 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SLC22A14-202ENST00000448498 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ADGRV1-237ENST00000640815 1522 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CARMN-201ENST00000505254 3950 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 KLHL32-204ENST00000536676 3699 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC079612.1-201ENST00000358775 3700 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 DDX31-205ENST00000438527 2814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SLC7A3-202ENST00000374299 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RPL19-201ENST00000225430 732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 OR10G4-201ENST00000320891 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 OR10G7-201ENST00000330487 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 HSD17B7-203ENST00000367915 507 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 OR10G9-201ENST00000375024 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RPL15P13-201ENST00000414329 645 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AKR1B1P4-201ENST00000426552 922 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RPL10P3-201ENST00000431607 468 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 MRPL52-205ENST00000432849 411 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 FOLR2-203ENST00000449475 1242 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 FOLR2-204ENST00000454954 951 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC092569.1-201ENST00000455192 258 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL109809.2-201ENST00000455216 493 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL18P-201ENST00000466851 291 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL285P-201ENST00000496478 264 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 H1FX-AS1-203ENST00000502789 922 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC091180.2-201ENST00000502823 545 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 GPHA2-203ENST00000533257 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC007376.1-201ENST00000557720 604 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RPL19-205ENST00000579374 690 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RPS27AP16-202ENST00000591758 566 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CYP2G1P-202ENST00000597833 870 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC021171.2-201ENST00000603006 1080 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ITGB2-AS1-205ENST00000609694 555 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 BX571673.1-201ENST00000621768 822 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC015978.1-201ENST00000635343 890 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 NBDY-204ENST00000637096 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LGSN-201ENST00000370657 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL645922.1-201ENST00000456570 3874 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 HMOX2-202ENST00000398595 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 POU6F2-207ENST00000518318 5925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SCMH1-209ENST00000397174 2977 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 TRAF1-202ENST00000540010 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 POLR3A-205ENST00000616246 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SNX6-201ENST00000362031 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL353597.3-201ENST00000624365 3745 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ADCY10P1-202ENST00000457653 3785 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SLC36A3-202ENST00000377713 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CCDC36-203ENST00000438782 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 NAA16-202ENST00000403412 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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