Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
FAM187BQ17R55 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms