Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC044839.3-201ENST00000532068 860 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
XCL2Q9UBD3 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
XCL2Q9UBD3 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms