Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SEMA3CQ99985 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SEMA3CQ99985 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 352.8 ms