Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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