Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NLRP3-204ENST00000366497 4318 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SCN5A-210ENST00000455624 7170 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PBRM1-205ENST00000409057 4980 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF469-201ENST00000437464 13203 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC024132.1-201ENST00000382007 2509 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AMMECR1L-202ENST00000393001 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GSN-AS1-201ENST00000414544 4763 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 VIL1-201ENST00000248444 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NOS2-201ENST00000313735 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01695-203ENST00000453420 4486 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SH3GLB1-201ENST00000370558 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DEPDC5-205ENST00000400248 5307 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TP53BP1-210ENST00000450115 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PDP2-201ENST00000311765 7146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DSCAML1-201ENST00000321322 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NLRC5-217ENST00000539144 6505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GABRR1-202ENST00000435811 3106 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PAN2-221ENST00000610546 5301 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LOXHD1-207ENST00000441551 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 L3MBTL4-203ENST00000400105 3546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SAR1B-201ENST00000402673 6682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms