Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZFP2-205ENST00000523286 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 REG1CP-205ENST00000444841 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SYTL2-228ENST00000533892 1441 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MIR106B-201ENST00000385301 82 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC019055.1-201ENST00000432822 443 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC00460-201ENST00000435024 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL512882.1-201ENST00000436086 832 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL161454.1-201ENST00000446226 569 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZNF32-AS1-201ENST00000453284 434 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL10P6-201ENST00000457497 318 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC023886.1-201ENST00000506057 685 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AP003385.2-201ENST00000524910 973 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 HHLA3-207ENST00000531950 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 Z98949.1-208ENST00000597614 816 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC02532-210ENST00000606430 584 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL021807.1-201ENST00000607175 565 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC239600.2-201ENST00000619615 1165 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL354719.2-201ENST00000429530 1454 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CASP12-201ENST00000375726 1306 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms