Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ASIC5-201ENST00000537611 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
E2F1Q01094 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms