Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC006978.2-201ENST00000442800 666 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 THSD7B-201ENST00000272643 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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