Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC074254.1-201ENST00000399152 404 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GAS8-AS1-201ENST00000408886 435 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL008626.1-201ENST00000412357 775 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR13D3P-201ENST00000412501 937 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NONOP2-201ENST00000414613 1231 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC004986.1-201ENST00000414855 607 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC010983.1-201ENST00000418387 1028 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL031584.2-201ENST00000420585 767 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZEB2-AS1-201ENST00000421083 453 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 VNN3-208ENST00000427187 1214 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SRGAP3-AS3-201ENST00000432981 1223 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC099344.1-201ENST00000433548 492 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FO393419.1-201ENST00000443746 355 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC093157.1-205ENST00000449473 1298 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MKNK1-207ENST00000465783 464 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PTPN20-219ENST00000508602 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC073648.1-201ENST00000508957 930 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PTPN20-221ENST00000509599 945 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PTPN20-223ENST00000509900 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR7E85P-201ENST00000512164 985 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PTPN20-228ENST00000513266 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TBX5-AS1-203ENST00000531202 822 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC006206.2-201ENST00000537192 992 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL133304.1-201ENST00000548199 549 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SPATA8-AS1-202ENST00000560888 392 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC026464.1-202ENST00000564737 722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CSAG4-202ENST00000583763 237 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC005518.2-201ENST00000603254 282 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 BX649601.1-201ENST00000608264 572 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CT45A9-202ENST00000620704 1010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL139220.2-211ENST00000628234 754 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC026950.2-201ENST00000633456 470 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CR589904.1-203ENST00000636515 318 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PAX8-AS1-213ENST00000609210 1328 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC106800.1-201ENST00000501221 1362 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 IL15-207ENST00000514653 1388 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 KLRB1-201ENST00000229402 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FER-209ENST00000618353 1420 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GLRA4-201ENST00000372617 1795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms