Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HECTD4Q9Y4D8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
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