Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HDGFL3Q9Y3E1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms