Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNRF3Q9ULT6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNRF3Q9ULT6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms