Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NRXN1Q9ULB1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN1Q9ULB1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms