Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GGA1Q9UJY5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GGA1Q9UJY5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms