Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
POLKQ9UBT6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms