Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMOD2Q9NZR1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMOD2Q9NZR1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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