Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DLL3Q9NYJ7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DLL3Q9NYJ7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms