Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBM28Q9NW13 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms