Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC3GQ9HC16 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms