Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RWDD1Q9H446 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RWDD1Q9H446 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms