Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLR1EQ9GZS1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1EQ9GZS1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms