Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms