Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM43Q9BTV4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms