Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAD9AQ99638 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAD9AQ99638 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAD9AQ99638 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAD9AQ99638 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD9AQ99638 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD9AQ99638 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD9AQ99638 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD9AQ99638 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD9AQ99638 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD9AQ99638 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAD9AQ99638 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD9AQ99638 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD9AQ99638 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAD9AQ99638 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD9AQ99638 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD9AQ99638 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAD9AQ99638 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAD9AQ99638 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAD9AQ99638 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD9AQ99638 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD9AQ99638 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD9AQ99638 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD9AQ99638 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms