Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POP1Q99575 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POP1Q99575 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POP1Q99575 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POP1Q99575 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POP1Q99575 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POP1Q99575 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POP1Q99575 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POP1Q99575 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POP1Q99575 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POP1Q99575 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POP1Q99575 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POP1Q99575 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POP1Q99575 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POP1Q99575 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POP1Q99575 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POP1Q99575 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POP1Q99575 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POP1Q99575 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms