Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP19Q99542 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP19Q99542 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms