Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCLT1Q96NL6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms