Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG1Q96JA1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LRIG1Q96JA1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms