Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED3Q96IU2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
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