Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM52Q96A61 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM52Q96A61 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms