Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLF2Q8IX21 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms