Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC6Q8IVU3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC6Q8IVU3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms