Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms