Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA5Q6Q788 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA5Q6Q788 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms