Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SAPCD1Q5SSQ6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms