Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNT1Q5JUK3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms