Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC178Q5BJE1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms