Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRDTQ58F21 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRDTQ58F21 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms