Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDCA8Q53HL2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA8Q53HL2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms