Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC142Q17RM4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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