Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IMPG1Q17R60 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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