Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B3Q16720 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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