Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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