Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZIC1Q15915 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms