Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NPTX1Q15818 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms