Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE3CQ15386 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE3CQ15386 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
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