Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TTF1Q15361 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF1Q15361 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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