Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPRRQ15256 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPRRQ15256 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPRRQ15256 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPRRQ15256 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPRRQ15256 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTPRRQ15256 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRRQ15256 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTPRRQ15256 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTPRRQ15256 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTPRRQ15256 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTPRRQ15256 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTPRRQ15256 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTPRRQ15256 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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PTPRRQ15256 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PTPRRQ15256 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRRQ15256 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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